欧盟期待已久的生物识别出入境系统（EES）于2026年4月10日正式全面启用，取代了对所有非欧盟旅客（包括澳大利亚人）的护照盖章。旅游业团体提醒旅客，在系统初期推广阶段，边境通关时间可能长达四小时。根据EES规定，旅客首次进入申根区时需提供指纹和实时面部图像，数据将保存三年并在后续旅行中重复使用。然而，去年试点该系统的机场报告称安检通道处理时间增加了70%。里斯本机场甚至因七小时的延误暂停了EES三个月。欧洲航空公司联盟（A4E）、国际航空运输协会（IATA）和国际机场理事会警告称，旺季拥堵可能波及机场内部运营，影响航班衔接。他们建议来自澳大利亚、加拿大和美国等免签国家的旅客提前抵达，使用欧盟“Travel to Europe”应用预先登记，并预订更长的转机时间。澳大利亚企业频繁往返欧洲的员工应调整安全责任培训，并考虑通过赫尔辛基或维也纳等较小入境点绕行，这些机场的通关效率预计恢复更快。旅行管理公司也在更新预测航班衔接风险的工具，以纳入EES处理时间。尽管澳大利亚的SmartGate系统已简化出境流程，但目前尚无针对澳大利亚人入境欧洲的快速通道。预计今年晚些时候，欧洲新的旅行授权系统ETIAS将与EES叠加，旅客需支付约7欧元的在线预审费用。
