EUの生体認証入出国システム（EES）は4月11日に本格稼働を開始し、現地ニュースブログのTala NewsがKNewsの分析を引用して報じたところによると、滞在超過やデータ不一致で「数千人」の旅行者が即座に入国を阻止されました。重要な点として、キプロスはアイルランドとともにまだEESの導入対象外であり、ラルナカおよびパフォス発着の便では引き続き手動でのパスポートスタンプが使用されています。シェンゲン圏の主要空港で足止めされた乗客のニュースがキプロスの住民や企業に不安をもたらす中、内務省は技術的統合が完了するまではキプロスの国境管理は従来の手続きを維持すると確認しており、完了は2026年末頃と見込まれています。これにより雇用主には一時的な猶予が与えられますが、コンプライアンスの更新は急務です。国境を越える通勤者やプロジェクトスタッフにとっては、乗り継ぎ時のリスクが最も大きくなっています。例えば、非EUの派遣社員がラルナカからアテネ経由でパリへ飛ぶ場合、アテネで指紋が登録されますが、同じ社員が別の経路で再入国しデータに不整合があれば、自動ゲートで滞在超過が検知される可能性があります。したがって、キプロスがシステム外であっても、モビリティチームは正確なシェンゲン入出国時間の記録を開始すべきです。移民弁護士は、キプロスが最終的にEESおよびETIASに参加する2026年8月3日の期限前に、従来のMEU 2/3居住許可証を生体認証カードに切り替えることを推奨しており、非生体認証書類は追加の検査を招く恐れがあります。対応策としては、従業員のパスポート有効期限の監査、居住カードの早期切り替え予約（パフォスの移民局は既に3～4か月待ち）、およびシェンゲン空港での乗り継ぎ時間が長くなることを旅行者に周知することが挙げられます。
