深圳气象台于6月13日下午连续发布雷暴、大风和雷电黄色预警，预警范围涵盖宝安区（深圳宝安国际机场所在地）、南山区及珠江口地区。预计阵风可达8级，强雷电将持续数小时。根据当地空管通报，空中交通管理部门已启动三级气象应急预案：调整起飞时隙，东部地区多个始发机场的进港航班被延迟起飞。尽管深圳机场早晨的航班起飞正常，中国南方航空和海南航空等多家航空公司提醒旅客当天晚些时候可能出现延误，并提供免费改签服务。此次暴风雨正值中国南方季风季节初期，深圳每年平均遭遇约十次强降雨影响。对于通过粤港澳大湾区调配员工的跨国企业，建议制定应急方案，如通过广州南站或香港西九龙高铁枢纽备选铁路线路，以减少错过转机的风险。负责从深圳出口区运输高价值电子产品的物流经理也应提前准备，防范停机坪滞留及广州至深圳高速公路可能出现的道路运输拥堵。市应急管理局提醒市民和游客尽量待在室内，固定松散的建筑材料，避免前往海滨长廊。此次黄色预警为中国四级气象预警体系中的第二高等级，若降雨加剧，预警级别可能进一步提升。
