欧盟移民协议刚刚生效数小时后，支撑新制度的核心生物识别数据库Eurodac于6月12日中午发生技术故障，荷兰当局证实。多国成员无法上传指纹，导致主要机场和陆路口岸不得不启用手动备份程序。欧盟委员会淡化了此次中断，称系统正在“逐步接入”，但边境官员私下警告，随着一线人员转用纸质流程，排队时间将延长。伦敦城机场、希思罗和曼彻斯特飞往欧盟枢纽的航空公司已提醒乘客预留更多时间。对英国企业而言，此次事件敲响警钟：脱欧后的出行环境越来越依赖英国无法控制的欧盟信息技术平台。任何系统不稳定都可能直接影响需接受申根入境检查的英国旅客。因此，制定应急预案——包括灵活的票务政策和与派遣人员的沟通机制——至关重要。Eurodac的停机还推迟了部分都柏林协议式遣返，因为无法及时匹配庇护申请，短期内可能导致前往英国的二次流动增加。内政部官员表示正“密切监控局势”，但尚未公布应对措施。此次事件也凸显了成员国是否具备技术准备迎接10月启用的独立入境/出境系统（EES）的更广泛担忧，该系统将适用于英国访客。
