就在欧盟庇护协议生效数小时后，柏林勃兰登堡机场（BER）于周五在5号航站楼内启用了专门的快速通道庇护中心。该设施是欧盟委员会指定德国设立的三个中心之一，初期容量为120张床位和20个面谈室。该中心旨在处理那些在抵达时申请庇护但根据新的欧盟“边境程序”规则被认为不太可能获得难民身份的人员。根据联邦移民和难民事务局（BAMF）的说法，中心将接待来自“安全国家”名单的国民、隐瞒或伪造身份文件的申请者以及被标记为安全风险的个人。案件必须在12周内完成，未获批准的申请者可直接从机场禁区驱逐，法律上不算进入德国境内。内政部长亚历山大·多布林特与勃兰登堡州州长迪特马尔·沃伊德克共同剪彩，称该中心是“有明确时限的有序庇护模式”。航空公司和地面服务商对这一一站式设计表示欢迎，指出此前临时程序常导致航司需在异地存放行李数周。权利组织则持怀疑态度。Pro Asyl警告称，该中心位于改造后的低成本航站楼，远离公共区域，存在“隐形拘留”的风险。该非政府组织要求法律顾问和独立监督员享有全面访问权；内政部表示访问将“视安全检查情况而定”，但在高峰抵达期可能受限。对跨国企业而言，该中心带来两大直接影响：机组人员必须将寻求庇护者直接送至该中心以避免罚款，高风险航线（尤其是来自高加索和北非的航班）将加强飞行前文件检查。通过BER调动员工的雇主应提醒旅客，机场内陆区通行时间将延长，并建议随身携带后续住宿证明，以避免二次盘问。
