德国各地的旅客已经开始感受到欧盟入境/出境系统（EES）带来的不便。9月29日，《本地报》发布的一份报告引用了众包排队追踪数据，显示慕尼黑机场的平均“最长”等待时间从2025年的31分钟飙升至2026年7月的60分钟，而柏林勃兰登堡机场周二下午的入境排队时间达到了63分钟。本月早些时候，法兰克福机场因技术故障，等待时间一度达到两小时高峰。自2025年10月起分阶段实施的EES系统，会采集所有非欧盟短期访客的指纹和面部扫描信息，有效期为三年。系统全面启用后，将取代护照盖章，并将数据上传至申根边境当局可访问的中央数据库。德国机场方面表示，该系统提升了安全性，但承认生物识别信息采集，尤其是首次登记，在高峰时段增加了操作复杂度。慕尼黑机场向当地媒体透露，已增设自动化自助终端并增加工作人员，但仍建议第三国旅客预留“明显更多”的时间。柏林勃兰登堡机场则实时发布等待时间预估，并提醒当多架宽体飞机同时抵达时，排队时间可能骤增。联邦警察局已为德国外部航空边境增聘450名警员，但工会表示，随着2027年跨海渡轮和欧洲之星终端纳入该系统，预计还需再增聘1000人。对于企业来说，运营影响显而易见。差旅经理反映，员工因排队错过火车换乘，且更多使用机场贵宾室日票以调整行程。一些企业开始将欧盟内部会议由飞机改为火车，以规避边检；另有企业试点“商务休闲”政策，允许员工多留一晚，避免晚间返程的风险。政策制定者正面临加快数字预登记的压力，但欧盟层面对远程生物识别采集的隐私担忧尚未解决。在此之前，德国机场敦促旅客，尤其是持新护照需重新登记者，提前抵达，并尽可能使用EasyPASS自动通关门。
