欧洲航空机构ACI Europe、Airlines 4 Europe和国际航空运输协会（IATA）于7月1日联合发布公开信，警告欧盟新实施的入境/出境系统（EES）在部分边境检查点造成了长达五小时的排队现象。西班牙的马德里-巴拉哈斯、特内里费南、帕尔马、阿利坎特和马拉加机场被列为受影响最严重的机场。航空公司担忧，7月至8月的旅游高峰期——西班牙旅客量比5月至6月多出4000万——将使现有设施不堪重负，因工作人员不足且生物识别自助终端尚未全面投入使用。根据EES规定，第三国旅客首次入境时必须采集指纹和面部图像，取代传统护照盖章。尽管成员国可在9月1日前给予“有限灵活性”，但业界认为这远远不够。他们呼吁欧盟委员会授权在旅客量超出承载能力时，预先暂停生物识别采集，并建立永久性的免除机制以应对未来高峰。布鲁塞尔已计划在“未来几天”与边境管理部门及航空业召开紧急会议。
对于个人旅客而言，VisaHQ等服务可提前确认所需证件，提供加急办理选项，缓解部分不便；其西班牙门户网站（https://www.visahq.com/spain/）实时跟踪EES最新动态，并为企业团体提供礼宾服务，帮助避免在检查点出现临时状况。
对于出行规划者来说，形势尤为严峻。西班牙沿海门户是该国以旅游为主导经济的关键枢纽，也是跨欧洲、非洲和拉美多国派遣人员的中转站。五小时的排队意味着错过转机、酒店超时入住及企业责任管理难题。企业被建议避开周末高峰安排员工和项目团队抵达，国际转机至少预留四小时，并考虑将快速通道服务纳入差旅政策。长期来看，此次争议暴露出结构性问题：原本设计为人工盖章流程的机场，现需腾出空间安装生物识别终端、自助登记区及家庭候检区。即便布鲁塞尔同意夏季暂缓执行，航空公司警告称，若西班牙不加快国家警察人员招聘及增设电子闸口，9月全面推行仍可能引发同样的混乱。
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